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DNAanylze
- DNA序列分析 ——基因序列 ——基因表达调控信息 寻找基因牵涉到两个方面的工作 ： 识别与基因相关的特殊序列信号 预测基因的编码区域 结合两个方面的结果确定基因的位置和结构 基因表达调控信息隐藏在基因的上游区域，在组成上具有一定的特征，可以通过序列分析识别这些特征 -DNA sequence analysis -- sequences -- gene expression and regulation of information
ULDA
- ULDA算法，能很好的应用于基因表达数据分析上，算法很新-ULDA algorithm, can be well applied in gene expression data analysis, the algorithm is a new
BTL3.4
- 利用这个模板可以分析基因表达数据，dna序列数据等
freeview_source
- 生物软件，基因表达相关。 FreeView is a gene expression dendrogram viewer. It allows easy viewing of gene expression dendrograms and zooming in on details in them using a variety of color and visualization schemes that can easily be created. Saving images of de
genexp
- 比对算法的具体应用DNA序列分析 ——基因序列 ——基因表达调控信息 寻找基因牵涉到两个方面的工作 ： 识别与基因相关的特殊序列信号 预测基因的编码区域 结合两个方面的结果确定基因的位置和结构 基因表达调控信息隐藏在基因的上游区域，在组成上具有一定的特征，可以通过序列分析识别这-Algorithms specific DNA sequence analysis applications- gene sequences- gene expression and regulation of info
gyy
- 从因子分析的角度出发解决基因表达谱分析问题。为解决独立成分分析方法在求解过程中的不稳定性，提出一种基于选择性独立成分分析的DNA微阵列数据集成分类器。首先对基因表达水平的重构误差进行分析，选择部分重构误差较小的独立成分进行样本重构，然后基于重构后的样本同时训练多个支持向量机基分类器，最后选择部分分类正确率较高的基分类器进行最大投票以得到最终结果。在3个常用测试集上验证了本文设计方法的有效性。-This paper tries to deal with gene expression proble
ga
- 一种多目标遗传算法策略的基因表达数据的基因选择的论文-A multi-objective genetic algorithm strategy for gene expression data for genetic selection of papers
HMMGEP-2.1
- 使用HMM对基因表达数据进行聚类,来自清华大学2003-use the HMM to clustering gene expression data
newstatana
- 对基因表达数据进行预处理的源程序，用来对基因进行聚类，采用均值为0，标准差为1-Pairs of gene expression data pre-processing of the source code used for gene clustering, using mean 0 and standard deviation of a
lyx
- 急性白血病的基因表达谱分析与亚型分类特征的鉴别-Analysis of gene expression in acute leukemia subtype classification and identification of characteristics
mathlab
- 急性白血病的基因表达谱分析与亚型分类特征的鉴别-Analysis of gene expression in acute leukemia subtype classification and identification of characteristics
feature_selection_similarity
- 肠型胃癌的基因表达谱数据。已经处理好。空缺值用均值代替。 第一行是肠型胃癌基因表达谱数据中样本的类别-肠型胃癌的基因表达谱数据。已经处理好。空缺值用均值代替。 第一行是肠型胃癌基因表达谱数据中样本的类别
IcEfx
- 找到时间序列基因表达数据的初始变化点，用以找到基因调控网络中对目标基因存在作用的潜在调控基因- the selection of the initial change expression points
geneweight
- 求基因权重的一个算法，基于辅助网络的协同聚类算法来发现基因表达数据与肿瘤的关系-An algorithm for gene weight, based on cooperative clustering algorithm to discover the relationship between the secondary network and tumor gene expression data
Sphere-Cover-Classifier-master
- 用matlab编程实现随机球覆盖集成分类器算法，首先在UCI数据集上得到很好的结果，然后在6个基因表达数据集通过一个案例说明。-Implement random ball cover integrated classifier algorithm using matlab programming, first get good results on UCI data set, and then in six gene expression data sets through a case des
deepbind
- DeepBind可以分析嘈杂的实验数据来确定一组的DNA和RNA序列的蛋白质将绑定。 然后,它可以看看一个新的序列,计算可能性有多大,这些蛋白质绑定到它。 给定一个序列突变,该工具可以分析是否绑定更改。 蛋白质结合位点突变,添加或删除可以改变基因表达模式和导致疾病。 -DeepBind can analyze noisy experimental data to determine a set of DNA and RNA sequences to which the protein wil
fenlei
- 单层竞争神经网络的数据分类,患者癌症发病预测。设法找出癌症与正常样本在基因表达水平上的区别，建立竞争网络模型去预测待检测样本是癌症还是是正常样本。-Data classification of single layer competitive neural network
AvergeProbe.R
- 在芯片处理过程中对RNA探针进行数据整合, 获得基因表达数值-average the probes of RNA
Relief
- 函数实现了lelief算法。（计算样本的每一个特征的分类权重，选出具有最大权重的一组特征。样本的特征就是基因）。 对权重较大的一组基因进行两两冗余分析。将相关性弱的和强相关中权重大的基因保留，即为特征基因。 已知基因表达谱数据、不同类样本的个数，自行设定分类特征的权重阈值。 对原始数据标准化的方法：（x－基因均值）/基因方差。 样本的类内类间距离采用欧氏距离。-Lelief function implements the algorithm. (Classificatio
NCIS
- 用来聚类基因表达数据,结合了基因互作网络(clustering the gene expression data)